Como todas especialidades, a Osteopatia possui as suas contra-indicações que descrevemos de forma geral a seguir:

• Fracturas,
• Estados infecciosos,
• Emergência hospitalar, por ex. apendicite, estomatite, entre outras (esta situação é avaliada no diagnóstico diferencial),
• Tumores (tumores intra-cranianos, entre outros),
• Aumento da pressão intra-craniana,
• Aneurisma, Meningite, Hemorragia, Epilepsia sem tratamento, Hipotensão (crânio-sacral), Gravidez,
• Psicopatias sem tratamento
• Luxações, síndrome de Down, Síndrome de Marfan
• Alterações graves de pele.

Após o tratamento é possível o surgimento de efeitos secundários menores de curta duração, tais como:

• Ficar dorido nas 24h seguintes ao tratamento ( a Osteopatia actua sobre a estrutura óssea/ligamentar e capsular/músculo-tendinosa),
• Redução do apetite (Crânio-sacral),
• Sonolência (Crânio-sacral),
• alterações da visão (Crânio-sacral),
• Tonturas, cefaleias (Crânio-sacral).